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dionysus神情困惑，拉菲在毛利叔的眼神扫到她附近之时，脸色立变。但她没能反应过来就已经被菲特劫持。
谈判室的自动门快速封闭。
菲特的手下马上调转了枪头与拉菲手下对峙，原先劫持着毛利兰的人放开毛利兰转而掏出枪抛给赤井。
dionysus对菲特的转变吃惊不已，只有拉菲恶狠狠的说果然如此。
菲特问毛利叔他是怎么发现的。
毛利叔说他一直察觉到组织的上层有fbi的高级间谍，而且还是直接受命最高层的。之前侵入资料库的时候就有看到消息传递。
原来菲特是fbi打入组织内部的最高级别间谍，从小就潜入组织，一直往上攀爬做到了如今的位置。
他故意挑起拉菲对远东的兴趣，一手促成三方势力的互斗，内耗组织的实力。一边架空欧洲的同时，一边通过和拉菲的内斗消灭北美和欧洲的高层势力。
这些年更是收集了许多资料就借着这次机会要重创组织。
因为他知道，罗曼的背后一直站着dionysus，而dionysus最大的目标是毛利叔。
就像dionysus用他们的动作掩饰自己查毛利叔的目的，他也利用dionysus查毛利叔的目的掩饰自己真实的计划。
他也猜到拉菲对他有所怀疑，所以任由bourbon监视他，同时让拉菲误认为bourbon才是真正的间谍。
这次行动他看到罗曼亲自前来就已经猜到，因而任由拉菲派bourbon和她手下的人去做袭击fbi和其他警察的任务，而排出自己大部分的手下作为包围这里的人手。
其中陪他走入这个房间的人已经由fbi的特工秘密替代了。
菲特隐藏了近二十年，自小在组织长大，因此他的叛变是连dionysus都没有猜到的。
菲特说只要这堵门降下，那么外面他的手下很快都会把拉菲和罗曼带来的人清除。虽然那些人都不是fbi的，但是他们全都听命与他，他之前和拉菲敌对的关系让那些人觉得杀死拉菲的手下情理之中。
而这个密闭的环境中，拥有绝对人数优势的是他们。
菲特感谢毛利叔为他创造的绝好条件。罗曼意识到毛利叔会来，根本就是猜到菲特的身份而来作一个赌博。
甚至于，之前插手菲特和拉菲露出马脚的行为都极可能是诱人入瓮的陷阱。
dionysus怒极反笑，他用枪指着黑羽快斗说在他手里还有这个人质的时候毛利叔就不敢轻举妄动，而这段时间足够他的手下把菲特这个叛徒的势力清理了。
毛利叔摇摇头说恐怕dionysus要失望了。他的手下非但来不了，还很可能被别人清理了。
他在扯下易容的时候就已经向别人发送的信号，那么长时间足够他们动手了。
dionysus说fbi的人还没这个能力，毛利叔说这可不是fbi，而是他在意大利的朋友帮得一次小忙。
dionysus说教皇的势力在黑羽快斗17岁以后已经撤离了，问毛利叔从哪儿来的意大利的朋友帮忙。
毛利叔说dionysus果然还是太失败了，他父亲很早就察觉的事他竟然到了现在还被蒙在骨子里，看来组织注定要毁在他手中。
罗曼接到电话，意大利黑手党联合日本当地势力插手干预了，还有来自德国的大财阀突然狙击组织名下的几家大公司。
毛利叔笑着告诉dionysus，即便他找了他那么多年，到头来还是一败涂地。
dionysus有些歇斯底里的问毛利叔为什么一直骗他，从第一次见面起，从名字到身份，从长相到年龄全都在骗他。当年又为什么一声不吭的假死丢下他离开。
毛利叔说正是因为dionysus的不冷静才导致如今这样的局面。他应该在一开始就认清自己和他的师徒关系不过是逢场作戏，不过是一场交易，一个筹码。
dionysus的父亲在毛利叔成为高层不久就猜到毛利叔的身份不简单，但他没有对毛利叔动手，反而赋予毛利叔更大的权力，同时把dionysus交给他。
两人曾有过一场私人对话，他希望毛利叔能够在普通情况下顾念和他儿子的情谊。又或者当两者对立之时，毛利叔能成为他儿子的试炼，验证dionysus是否有资格成为合格的组织领导。
他希望毛利叔留dionysus一条命。至于组织的存在，如果dionysus真的成不了事，那么组织毁在他手里也理所当然。
毛利叔告诉dionysus，九年前他没有出手毁了组织，九年后他也不会出手。但并不是他没有这个能力，就像他当初很简单就毁了远东的根基，现在毁了组织也不是难事。
他问dionysus，是要他真的动手，还是放弃对他的念头放了黑羽快斗？
dionysus不愿意，而罗曼在毛利叔的眼神扫向他的时候突然出手击晕了dionysus，他用黑羽快斗和毛利叔达成暂时协议。黑手党退出争锋，毛利叔停止对组织的行动。他们要安全离开这里。
至于以后黑手党是否还要分一瓢羹，fbi又有什么行动那要看他们应对的本领，和毛利叔无关。罗曼承诺不再找毛利叔。
毛利叔从他的语气中听到了取而代之的意图，两人心照不宣的一笑。接着罗曼接到黑手党撤离的消息，放了黑羽快斗，趁fbi未反应过来，抱着dionysus从事先以防万一的暗道逃离。
余下的菲特仍然劫持着拉菲，因此拉菲的手下不敢轻举妄动，众人松了口气，开始琢磨如何从这里安全离开。
对罗曼的逃离，菲特并没有异议，但他也知道一旦放虎归山，接下来他们想离开这里就不容易了。
果然他收到心腹的消息，罗曼安插的人在破坏他对整个基地的控制力。好在现在事态未失控。
菲特劫持拉菲，让她命令几个手下束手就擒。拉菲照做。
一行人通过接受监控中心反馈的消息快速撤离。
妃英理毛利兰等人由赤井秀一带着率先离开，毛利叔和菲特及一干人员断后。
拉菲走着走着突然和菲特分析罗曼这次回去以后会作的动作，她还说就算她能活着走出这里，也失去了在北美的权力。
菲特说只要拉菲愿意，他能帮她申请证人保护计划。拉菲却不屑。
正在此时，监控室与菲特的联系中断了。菲特的手下一失神，之前非常安静的gin忽然出手夺过压制他的□□。连续射伤了两名fbi特工，枪声引来了守备人员的注意。场面非常混乱，赤井秀一等人被组织的人发现，他们虽然是菲特的手下但不是fbi的人，因此立刻掏枪追杀赤井等人。
毛利叔不得不前去帮忙，这其中柯南虽被毛利叔救了一次却仍然在保护小兰时胸部中弹，性命垂危。
菲特一分神，拉菲就借机逃脱，菲特只得率领手下追踪拉菲，双方混战。
拉菲废了菲特的一只手，但在最后关头没下杀手，最终被菲特击毙。菲特抱着拉菲的尸体等来了fbi的支援。
gin和之前切断通讯造成混乱的基蒂安等人汇合，本想趁乱逃走但与救出灰原哀的贝尔摩德碰面。双方缠斗的时间令gin丧失了最好的逃脱机会。
gin被赶过来的fbi击毙。fbi问vermouth是否和他们一起出去。vermouth拒绝了，她让fbi带走灰原哀，自己独自一人离开。从此不再出现。
柯南被送往医院做手术，小兰因为精神打击过大也被要求住院观察。
fbi清扫了在日本残余的组织势力，尽管没能找到罗曼，但成果斐然，几乎连根拔除了组织。
一切都恢复平静，帕帕和riphath告诉毛利叔菲特死了，死在fbi的手里。和拉菲被葬在一起。
两人把aptx4869的解药交给毛利叔。毛利叔感谢帕帕出手狙击组织的公司。帕帕则问他怎么处理接下来的事。
但两人都没等毛利叔回答就离开了。
毛利叔找到妃英理，他向她解释了一切。包括自己杀了曾经的毛利小五郎，故意和她分居掩饰自己，九年前之所以突然颓废也是因为黑羽盗一之死。
他告诉妃英理，当时他为了忘记黑羽盗一的死自我催眠，模拟了新的人格，这也是为什么后来变成那副样子。
而之所以记忆恢复是因为柯南和黑羽快斗。
毛利叔还说，他在这场决斗下定公开自己身份之前就已经做好离开的准备。因为他再待在这儿，只是徒增危险。
讲完这一切，两人都默认无语，而偷偷在妃英理身上放了窃听器的小兰被这样的过去以及之前就察觉的工藤新一喜欢父亲的事实击垮，彻底崩溃。
妃英理接到医生的电话和毛利叔紧急赶回医院。
在病床前，毛利叔跪在昏迷不醒的小兰面前忏悔。妃英理说毛利叔既然选择离开，那么以后都不再出现在小兰面前，她自己也将带着小兰离开日本。
毛利叔答应了，同时希望妃英理能到英国让小兰继承他的公爵之位。一方面是作为补偿，一方面也希望小兰能替他照顾年迈的威灵顿公爵的晚年。
毛利叔最终离开了，送行的人是独自前来的工藤优作。毛利叔坦言如今的自己真的把所有伪装揭下才彻底解脱了出来，之前一直徘徊于盗一的死并不是纯粹对盗一的爱，而是他对他自己的不能释怀。尽管最后他只能以这样的方式收场，甚至没有机会去补偿小兰和英理这些被他伤害过的人，但他有下半辈子去坦诚的忏悔罪孽去思念盗一。
工藤优作说如果九年前在中国碰到的毛利叔是现在这样的话，或许他会变成一个愚蠢的爱慕者。但他终究有家庭，毛利叔也不是现在的毛利叔。所以他现在可以平静的站在这里送行。
毛利叔想起九年前因为盗一之死，他独自去中国旅行时碰到工藤优作并发生露水姻缘的事，联系现在，两人最终只是互相报以释然的笑。
飞机，两人分别。
工藤优作离开机场的时候碰到赶来的黑羽快斗，黑羽快斗看着的飞机说自己会一辈子追下去，直到找到毛利叔。
几天后柯南醒来服下解药变回工藤新一，从优作口中得知毛利叔离开的消息失魂落魄。之后毛利兰被妃英理带到英国疗养，两人关系断绝。
工藤优作拜托灰原哀照顾工藤新一，两人结婚，但工藤新一一直念着毛利叔，却在家人的制止下和灰原哀做了一对表面上的夫妻。
数年后灰原哀心力交瘁，而工藤新一却想挽回这段婚姻，灰原哀提出离婚，两人从恋爱重新开始。
毛利兰在英国疗养了数年，最后和白马探成婚。
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